Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pan3Q640Q5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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