Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfe3Q64092 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms