Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms