Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpd52Q62393 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms