Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt6hQ62383 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt6hQ62383 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms