Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall3Q62255 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sall3Q62255 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms