Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms