Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sycp1Q62209 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms