Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttf1Q62187 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms