Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhocQ62159 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RhocQ62159 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhocQ62159 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms