Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim27Q62158 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms