Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Odf1Q61999 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Odf1Q61999 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Odf1Q61999 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Odf1Q61999 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Odf1Q61999 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Odf1Q61999 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Odf1Q61999 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Odf1Q61999 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Odf1Q61999 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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