Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt33bQ61897 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt33bQ61897 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.2 ms