Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd47Q61735 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd47Q61735 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms