Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccna1Q61456 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccna1Q61456 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms