Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd53Q61451 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd53Q61451 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd53Q61451 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms