Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift88Q61371 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift88Q61371 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms