Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctnna2Q61301 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctnna2Q61301 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms