Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxd3Q61060 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms