Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxg1Q60987 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms