Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
JrkQ60976 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms