Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DbpQ60925 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DbpQ60925 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DbpQ60925 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms