Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnot7Q60809 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot7Q60809 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms