Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf4Q60793 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf4Q60793 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms