Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Epha1Q60750 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha1Q60750 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms