Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samhd1Q60710 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samhd1Q60710 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samhd1Q60710 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms