Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SkiQ60698 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SkiQ60698 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms