Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sik1Q60670 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sik1Q60670 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms