Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a3Q5XF89 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a3Q5XF89 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms