Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf1Q5U4C3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf1Q5U4C3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Scaf1Q5U4C3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms