Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdcp1Q5U462 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdcp1Q5U462 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms