Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13Q5SWW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms