Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsr1Q5SWD9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms