Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LpoQ5SW46 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LpoQ5SW46 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LpoQ5SW46 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms