Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms