Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc42Q5SV66 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc42Q5SV66 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms