Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bbs12Q5SUD9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms