Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AbrQ5SSL4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AbrQ5SSL4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms