Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Utp18Q5SSI6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms