Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r223Q5SSA0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r223Q5SSA0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r223Q5SSA0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r223Q5SSA0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms