Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930512M02RikQ5SQK8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930512M02RikQ5SQK8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms