Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm27Q5SFM8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms