Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d4Q5RJF7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms