Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCM1

Slc17a4, Probable small intestine urate exporter, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a4Q5NCM1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc17a4Q5NCM1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a4Q5NCM1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms