Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Trim41Q5NCC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Trim41Q5NCC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms