Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1810065E05RikQ5NC41 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms