Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf2Q5NC05 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttf2Q5NC05 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms