Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf3Q5HZG4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms