Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SynaQ5G5D5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SynaQ5G5D5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms