Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q5EBG8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q5EBG8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q5EBG8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q5EBG8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q5EBG8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms